Le Gratteris est une commune française située dans le département du Doubs en région Bourgogne-Franche-Comté. Par ailleurs la commune fait partie de l’aire d’attraction du Grand Besançon, dont elle est l’une des plus petites communes de la couronne. L’occupation des sols de la commune est marquée par l’importance des forêts et milieux semi-naturels (54,6 %).